サービスの流れ
ライブラリー作製
当社では、以下のフローでお客様からのご依頼にお応えしています。
ご不明な点があれば、お問い合わせからお気軽にお送りください。
- お問い合わせ
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当ウェブサイトでサービス内容及び参考価格をご確認ください。
サービス内容や納期などのご質問はお問い合わせから、参考価格のご確認やお見積書をご希望の方はこちらからお願いします。個別のご要望や作業内容がございましたら、秘密保持契約を締結し、研究内容をお伺いします。
なお、御見積書はお客様の所在地により、当社又は当社代理店から発行いたします。
- ご発注
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サービス内容等の確定後、発注書を発行していただきます。
- ご案内
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細胞準備や送付方法についてご案内します。
- サンプルご送付
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ご用意いただいたサンプルをドライアイス同封で当社までご送付ください（受け取りは平日のみ）。
サンプルの受入条件は以下の通りです。
- サンプルは凍結状態である
- 細胞数は100万細胞以上ある
- 生存率は80%以上ある
なお、ご提出いただいたサンプルが受入条件に満たない場合は、解析できかねます（サンプル到着後2週間以内に確認します）。
──ヒト生体試料・臨床検体の場合
ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られた臨床研究計画に従い、匿名化してご送付ください。適用のある法令、規則及びガイドラインを遵守した上で、本サンプルを当社にご提供ください。──遺伝子組換え生物の場合
「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律」にもとづき、遺伝子情報の提供をお願いいたします。
また、納品物が遺伝子組換え生物に該当する場合、ご使用に際しては、「研究開発等に係る遺伝子組換え生物等の第二種使用等に当たって執るべき拡散防止措置を定める省令」（平成16年文科省・環境省令第1号）及び組織内の安全委員会の指示に従ってください。
- 作業実施
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作業内容をフローチャートで随時アップデート致しますので、サンプルの状況をいつでもご確認いただけます。
お客様からご依頼いただく作業につきましては、当社内のほか、国内業務提携先に再委託する場合がございます。再委託の場合、当社が負う義務を当該関連会社に遵守させることを保証いたします。
実験内容によっては、追加料金をいただくこともございます。その場合は事前にご相談致します。
- 納品
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受託内容に応じた納品物を送付致します。
納品物がデータの場合は、HDにて送付 / データダウンロードをご選択いただけます。
- お支払い
- 請求書にしたがってお支払いをお願いいたします。
- サンプル及び
解析データの保管 -
お客様からご提供いただいたサンプル及び解析データ等は、納品後、3ヵ月を経過すると廃棄いたします。予めご了承ください。
バイオインフォマティクス解析
当社では、以下のフローでお客様からのご依頼にお応えしています。
その他ご不明点がある場合は、お問い合わせからお気軽にお送りください。
- お問い合わせ
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ご希望の方はお問い合わせからご連絡ください。
- 秘密保持契約(NDA)
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秘密保持契約 (NDA) を締結後、研究内容をお伺いします。
- 事前ヒアリング・見積
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以下データをご提出いただきます。
- サンプル情報
- 実験情報
- 解析内容
ご希望の解析結果について、公になっている論文等でイメージに近いものがあれば、ご用意いただけますとスムーズです。
事前ヒアリングの内容を基に御見積を作成します（御見積書はお客様の所在地により、当社又は当社代理店が発行します）。
- 発注
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見積の内容にご了承いただければ、発注書を発行していただきます。
- Fastqデータご送付
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お客様からFastqデータをご提出ください。
- 作業実施
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当社でバイオインフォマティクス解析を行います。
なお作業期間が長い場合は、解析状況を中間報告致します。
- 納品・報告書送付
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解析が完了後、データをお送りします。 納品方法は、HDにて送付 / データダウンロードをご選択いただけます。
解析のやり直しは1回限り可能です。
- お支払い
- 請求書にしたがってお支払いをお願いいたします。
- サンプル情報及び
解析データの保管 -
お客様からご提供いただいたサンプル情報及び解析データ等は、納品後、3ヵ月を経過すると廃棄致します。予めご了承ください。
Visium 空間的遺伝子発現解析
当社では、以下のフローでお客様からのご依頼にお応えしています。
その他ご不明点がある場合は、お問い合わせからお気軽にお送りください。
- お問い合わせ
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当ウェブサイトでサービス内容及び参考価格をご確認ください。 サービス内容や納期などのご質問、御見積り及びご発注をご希望の方はお問い合わせからご連絡をお願いします。 なお、参考価格をご確認いただいた場合、参考価格番号を入力いただければお問い合わせをスムーズに行っていただくことができます。
また、個別のご要望や作業内容がございましたら、秘密保持契約を締結し、研究内容をお伺いします。お問い合わせからご相談ください。
御見積書はお客様の所在地により、当社又は当社代理店から発行いたします。
- 事前にご確認いだく事項
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Visium CytAssist for FFPE Visium FF（新鮮凍結） - HE染色・イメージングし、崩れがないことを確認している
スライドの貼り付け位置に切片が貼り付けられていること。
(6.5mm x 6.5mmの場合) キャプチャーエリアより大きな切片の場合、中心位置を指定したスライドを提出すること。切片のサイズはキャプチャーエリア (6.5mm x 6.5mm) 以内に収まること 薄切片を5 µm以下で切り出せること 薄切片を10 µm以下で切り出せること 以下のいずれかのガラススライドに切片を貼り付けていること
注）国内に流通しているスライドの中には対応できないサイズのものがありますので、必ずご確認ください
- Epredia Shandon ColorFrost Plus
- Fisher SuperFrost/ColorFrost
- Sigma-Aldrich Poly Prep Slides
- VWR SuperFrost Plus
包埋方法はOCTのみ。 規定品を使用していること
Tissue-Tek* O.C.T. Compound 25608-930（サクラファインテック）
既定の方法で凍結し、組織切片を作製・切り出していること– （弊社へ委託可能） GEXの解析を行うサンプルは、TOによる細胞透過酵素の反応時間を検討済みである サンプル中のRNAの品質が高いこと
(弊社へ委託可能)FFPEから薄片を切り出しRNA抽出を行い、DV200が30%以上であることを確認していることサンプル中のRNAの品質が高いこと
（弊社へ委託可能） 事前に、OCT包埋組織から薄片を切り出しRNA抽出を行い、RIN値が７以上であることを確認していること外部リンク：Visium CytAssist Spatial Gene Expression for FFPE – Tissue Preparation Guide 外部リンク：Visium Spatial Protocols – Tissue Preparation Guide
- 事前にご提出いただく
データ -
- HE染色画像：ダメージの少ない組織切片であることを確認します。
- FFPEサンプルの場合：組織のDV200値：30%以上あることを確認します。
- 新鮮凍結サンプルの場合：組織のRIN値：7以上あることを確認します。
- ご発注
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サービス内容等の確定後、発注書を発行していただきます。
- ** ご案内・スライド送付
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Tissue Optimization用またはGene Expression用のスライドをお送りします。
送付方法についてご案内します。
- ** 組織をスライドに貼りつけ
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TO：同組織ブロックのサンプルから7枚
GEX (CytAssist for FFPE)：1スライド内に2枚（別々のサンプルでもよい）
GEX (FF)：1スライド内に4枚（別々のサンプルでもよい）
- サンプルご送付
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ご用意いただいたスライドをドライアイス同封で当社までご送付ください（受け取りは平日のみ）。
- 作業実施
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お客様からご依頼いただく作業につきましては、当社内のほか、国内業務提携先に再委託する場合がございます。再委託の場合、当社が負う義務を当該関連会社に遵守させることを保証いたします。
実験内容によっては、追加料金をいただくこともございます。その場合は事前にご相談致します。
- 納品
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受託内容に応じた納品物を送付致します。
納品物がデータの場合は、HDDにて送付致します。
納品物に起因して、直接的又は間接的に発生したお客様の損害については、明らかに当社の責に帰すべき事由による場合を除いて、当社は一切その責任を負いません。
- お支払い
- 請求書にしたがってお支払いをお願いいたします。
- サンプル及び
解析データの保管 -
お客様からご提供いただいたサンプル及び解析データ等は、納品後、3ヵ月を経過すると廃棄いたします。予めご了承ください。